Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms