Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LOXL1Q08397 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.1 ms