Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms