Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PROCR-201ENST00000216968 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RN7SL519P-201ENST00000497925 288 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms