Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUCB1Q02818 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms