Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCNT1Q02742 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms