Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NHLH2Q02577 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms