Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MC1RQ01726 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MC1RQ01726 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MC1RQ01726 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MC1RQ01726 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MC1RQ01726 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MC1RQ01726 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MC1RQ01726 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms