Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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