Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms