Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms