Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYBPC1Q00872 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms