Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLTCQ00610 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLTCQ00610 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms