Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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FAM3AP98173 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3AP98173 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3AP98173 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3AP98173 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3AP98173 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3AP98173 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3AP98173 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3AP98173 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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