Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNB1P98172 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNB1P98172 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms