Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB1P82279 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms