Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HBBP68871 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HBBP68871 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HBBP68871 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms