Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPNP63162 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms