Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERVK_113P63132 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERVK_113P63132 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms