Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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