Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA6P60900 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA6P60900 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms