Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MTPNP58546 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTPNP58546 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTPNP58546 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTPNP58546 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTPNP58546 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTPNP58546 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MTPNP58546 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms