Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXW4P57775 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms