Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BGRP55822 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms