Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA2D1P54289 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D1P54289 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms