Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBX2P52951 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GBX2P52951 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX2P52951 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms