Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTDSS1P48651 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms