Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RANGAP1P46060 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RANGAP1P46060 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms