Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC1A3P43003 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms