Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CAPGP40121 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CAPGP40121 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CAPGP40121 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CAPGP40121 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPGP40121 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPGP40121 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CAPGP40121 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms