Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITGAEP38570 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms