Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP214P35658 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP214P35658 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP214P35658 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP214P35658 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP214P35658 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms