Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC1P35052 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC1P35052 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC1P35052 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPC1P35052 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPC1P35052 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms