Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms