Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHC1P29353 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHC1P29353 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms