Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMBRP28336 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMBRP28336 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NMBRP28336 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NMBRP28336 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NMBRP28336 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NMBRP28336 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NMBRP28336 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NMBRP28336 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NMBRP28336 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms