Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA3P26006 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms