Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSSP25774 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSSP25774 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSSP25774 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSSP25774 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms