Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIG1P18858 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIG1P18858 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIG1P18858 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms