Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB4P16144 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB4P16144 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB4P16144 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB4P16144 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms