Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CFTRP13569 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFTRP13569 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFTRP13569 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFTRP13569 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFTRP13569 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFTRP13569 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFTRP13569 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFTRP13569 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFTRP13569 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFTRP13569 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFTRP13569 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFTRP13569 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms