Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A1P12074 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms