Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C8orf88P0DMB2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms