Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM228BP0C875 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM228BP0C875 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms