Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HSP90AB1P08238 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSP90AB1P08238 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms