Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVILO95425 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVILO95425 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVILO95425 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms