Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPO95166 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPO95166 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms