Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SOGA1O94964 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOGA1O94964 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms