Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF254O75437 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF254O75437 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF254O75437 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms