Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP2O75323 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms